En el año 2005, un virus de computadora colapsa toda la red, provocando cientos de catastrofes. Debido a esto las redes de Internet son altamente restringidas y protegidas por diversos controles y reglamentaciones. Dos años después del incidente las redes son abiertas al publico, y miles de usuarios ingresan en lo ultimo en MMORPG (Massive Multiplayer Online Role-Playing Game / Juego Masivo Multijugador de Rol en Línea)

La nueva atracción de la Red es “The World”, un mundo  virtual de fantasía en donde los personajes pueden ser diversas clases, aventurarse para ir es busca Calabozo, o juntarse con otros jugadores para formar equipos. Eliminar monstruos subir niveles y habilidades, recoger nuevos artículos y participa en acontecimientos especiales, son algunas de las opciones que este nuevo mundo ofrece a sus usuarios. Los jugadores comienzan en ciudades, que contienen tiendas, puntos donde se pueden salvar los personajes y la Puertas del Caos (Chaos Gates) que utilizan para viajar a diversos servidores del juego. Este mundo virtual fue creado por Harald Hoerwick, con el fin de diseñar un nuevo tipo de inteligencia artificial, utilizando las emociones y aspectos psicológicos de los jugadores.

A principios del 2010, la mente de un Wavemaster llamado Tsukasa queda atrapada en el juego mismo. El cuerpo de Tsukasa está en un coma en de la vida real, pero el personaje Tsukasa todavía está jugando el juego. Mientras que progresa la historia se introducen muchos personajes, algunos que deseen ayudarlo, algunos que tienen metas más egoístas. Entonces las preguntas se presentan en cuanto a qué está sucediendo realmente en el juego. Los distintos personajes como Mimiru, Subaru y Bear, intentan acercarse y ayudar a Tsukasa, aunque el cada vez se encierra mas en si mismo. Lentamente comienzan a formase fuertes lazos de amistad entre los personajes, especialmente entre Tsukasa y Subaru, quien termina teniendo una parte esencial al final de la serie.

Finalmente la historia se centra en la búsqueda de la “Llave del Crepusculo”, un artefacto poderoso dentro del juego que podría servir para descubrir que es lo que le sucedió a Tsukasa. Esto los conduce a los lugares mas inhóspitos del “mundo”, donde descubren los secretos de “The Wordl”  y Tsukasa se enfrenta a sus peores temores.